Eesti Maaülikooli seaduse kohaselt on nõukogu ülikooli kõrgeim juhtorgan, kes vastutab ülikooli pikaajalise ja kestliku arengu ning oluliste majandus-, finants- ja varaga seotud otsuste tegemise eest, tagades ülikooli eesmärkide saavutamise.
Ülikooli uus nõukogu koosseis alustas tööd jaanuaris 2025.
Nõukogu esimees, akadeemik
Raitwood / AS Rait juhatuse esimees
Anu Ait OÜ juht, Eesti Tõusigade Aretusühistu tegevjuht ja juhatuse liige
eAgronom OÜ tegevjuht
Eesti Maaülikooli metsandusökonoomika professor
Eesti Maaülikooli karjatervise professor
Eesti Maaülikooli maamajanduse ökonoomika tenuuriprofessor